香港作為世界知名的金融中心和自由港，吸引了全世界大部分跨國公司在香港設立分公司，而這也為香港帶來了許許多多的機遇。因此，很多內地公司也在香港設立公司。在實際經營中，經常會碰到內地公司和香港公司哪方為實際管理機構的問題。下面給大家介紹，如何認定香港公司與內地公司關聯的實際管理機構？
一、國稅發(fā)[2009]82號規(guī)定，香港子公司同時符合以下條件的將認定實際管理機構在中國大陸。
1.香港子公司負責實施日常生產經營管理運作的高層管理人員、及其高層管理部門履行職責的場所，主要位于中國境內；
2.香港子公司的財務決策（如借款、放款、融資、財務風險管理等）、人事決策（如任命、解聘和薪酬等）由位于中國境內的機構或人員決定，或需要得到位于中國境內的機構或人員批準；
3.香港子公司的主要財產、會計賬簿、公司印章、董事會和股東會議紀要檔案等位于或存放于中國境內；
4.香港子公司1/2（含1/2）以上有投票權的董事或高層管理人員經常居住于中國境內。
二、根據《國家稅務總局關于印發(fā)<境外注冊中資控股居民企業(yè)所得稅管理辦法（試行）>的公告》（國家稅務總局公告2011年第45號），境外中資企業(yè)居民身份的認定，采用企業(yè)自行判定提請稅務機關認定和稅務機關調查發(fā)現予以認定兩種形式，并自收到居民身份認定書之日起30日內辦理稅務登記。賬簿憑證要使用中文，并報送稅務機關備案，發(fā)票存根應當保存在中國境內，以備稅務機關查驗。
1.當香港公司被認定為大陸居民企業(yè)后，因同時也是依照香港法律設立的法團公司，將具有雙重居民身份，根據《內地和香港特別行政區(qū)關于針對所得避免雙重征稅和防止偷漏稅的安排》第4條第3款規(guī)定，除個人以外，同時為雙方居民的人，應認為是其實際管理機構所在一方的居民。因此，實際管理機構被判定在大陸的香港子公司取得所得應在大陸繳稅，無需在香港繳納利得稅。
2.如香港子公司被認定為非境內注冊居民企業(yè)，應履行居民企業(yè)納稅義務
境內公司設立香港子公司，符合非境內注冊居民企業(yè)的認定條件的，應遵照國內企業(yè)所得稅的管理。
根據《國家稅務總局關于印發(fā)<境外注冊中資控股居民企業(yè)所得稅管理辦法（試行）>的公告》（國家稅務總局公告2011年第45號）第四條“非境內注冊居民企業(yè)應當按照企業(yè)所得稅法及其實施條例和相關管理規(guī)定的要求，履行居民企業(yè)所得稅納稅義務，并在向非居民企業(yè)支付企業(yè)所得稅法第三條第三款規(guī)定的款項時，依法代扣代繳企業(yè)所得稅。”
即香港子公司被認定為非境內注冊居民企業(yè)的話，必須按境內規(guī)定依法代扣代繳企業(yè)所得稅，有些境內企業(yè)設立香港子公司的目的（避免代扣代繳稅款）也就無從實現。
以上就是關于如何認定香港公司與內地公司關聯的實際管理機構？的簡單解答，由此可見，內地企業(yè)在香港設立公司，將會牽涉到多個方面的管理權認定，而這就需要一家專業(yè)秘書公司為您答疑解惑。